Посмотрел схему. Оказывается, что с кнопки идет не только на GPIO мультиконтроллера, но и через конденсатор С1497 (формирующий импульс) на триггер U1022, который на время разряда конденсатора переключается в 0, и он идет на вход ЮМ.
После нажатия на кнопку или после программного выключения на кнопке (и соответственно, на GPIO мультиконтроллера) устанавливается 0 (+V3AL остается в 3.3 В).

И что сажает на землю эту точку после выключения? Мульт? И по этой причине в момент выключения С1497 разряжается, устанавливая на входе 2 триггера ноль и запуская тем самым плату вновь? А почему?